Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cobll1Q3UMF0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms