Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b2Q3UJB0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms