Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod2Q3UHZ5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod2Q3UHZ5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms