Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yipf3Q3UDR8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms