Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trip13Q3UA06 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms