Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Hvcn1Q3U2S8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
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Hvcn1Q3U2S8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hvcn1Q3U2S8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Hvcn1Q3U2S8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Hvcn1Q3U2S8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Hvcn1Q3U2S8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hvcn1Q3U2S8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms