Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms