Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2f1Q3THK3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf2f1Q3THK3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf2f1Q3THK3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms