Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccbe1Q3MI99 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms