Protein–RNA interactions for Protein: Q3I5G5

Foxi2, Forkhead box protein I2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxi2Q3I5G5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxi2Q3I5G5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms