Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ptchd1Q14B62 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ptchd1Q14B62 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ptchd1Q14B62 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ptchd1Q14B62 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ptchd1Q14B62 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ptchd1Q14B62 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ptchd1Q14B62 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ptchd1Q14B62 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ptchd1Q14B62 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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