Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms