Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spata18Q0P557 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms