Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Neurl1bQ0MW30 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms