Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.8 ms