Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gata4Q08369 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms