Protein–RNA interactions for Protein: Q08288

Lyar, Cell growth-regulating nucleolar protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LyarQ08288 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms