Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prrx2Q06348 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Prrx2Q06348 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms