Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apoc2Q05020 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms