Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms