Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col6a1Q04857 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms