Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms