Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms