Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms