Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms