Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms