Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Serpina1cQ00896 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms