Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shc1P98083 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shc1P98083 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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