Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gfra1P97785 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gfra1P97785 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gfra1P97785 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra1P97785 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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