Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gata5P97489 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata5P97489 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gata5P97489 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms