Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Meis3P97368 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Meis3P97368 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Meis3P97368 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Meis3P97368 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Meis3P97368 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Meis3P97368 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Meis3P97368 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Meis3P97368 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Meis3P97368 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Meis3P97368 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Meis3P97368 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Meis3P97368 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Meis3P97368 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Meis3P97368 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Meis3P97368 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms