Protein–RNA interactions for Protein: P97357

Taf1a, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1aP97357 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1aP97357 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms