Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H3f3aP84244 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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