Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms