Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TgfbiP82198 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfbiP82198 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms