Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx1P81068 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx1P81068 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx1P81068 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Irx1P81068 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx1P81068 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx1P81068 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms