Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sparcl1P70663 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sparcl1P70663 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms