Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms