Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp9xP70398 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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