Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms