Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra8P70278 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra8P70278 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Stra8P70278 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra8P70278 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra8P70278 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra8P70278 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra8P70278 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stra8P70278 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms