Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps27aP62983 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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