Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vsnl1P62761 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vsnl1P62761 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms