Protein–RNA interactions for Protein: P62500

Tsc22d1, TSC22 domain family protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d1P62500 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms