Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpd2P62317 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd2P62317 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms