Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ufm1P61961 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms