Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copz1P61924 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copz1P61924 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copz1P61924 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms