Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga11P61622 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms