Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg6P61406 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg6P61406 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg6P61406 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms