Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme3P61290 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme3P61290 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psme3P61290 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms